La misión específica de la Universidad Pontificia de la Santa Cruz es la de profundizar en el contenido intelectual y la riqueza antropológica de la fe, estableciendo al mismo tiempo un diálogo con la cultura contemporánea.

Nuestro empeño es el mismo que durante siglos ha dado lugar a la institución universitaria en Europa, es decir, el rigor intelectual de la investigación al servicio de una fe que desea comprender para vivir y, comprendiendo, ser capaz de demostrar las razones de su esperanza.

La Santa Cruz va al encuentro de los  desafíos del mundo moderno, que presenta sombras pero también grandes posibilidades, formando hombres y mujeres de fe – sacerdotes, religiosos y religiosas, laicos y laicas – los cuales gracias a una fe asimilada intelectualmente con profundidad se hacen capaces de establecer un diálogo con la modernidad y de proponer con convicción y de forma convincente la luz de Cristo.